Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLRMTO00411 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLRMTO00411 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms