Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFKBIEO00221 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms