Protein–RNA interactions for Protein: A6PVI3

NCBP2L, Nuclear cap-binding protein subunit 2-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP2LA6PVI3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms