Protein–RNA interactions for Protein: A6NI47

POTEM, Putative POTE ankyrin domain family member M, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEMA6NI47 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms