Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SHOC2Q9UQ13 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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