Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CIPCQ9C0C6 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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