Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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