Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
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SGCAQ16586 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
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SGCAQ16586 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
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SGCAQ16586 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
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SGCAQ16586 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
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SGCAQ16586 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCAQ16586 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
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