Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
USF2Q15853 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
USF2Q15853 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
USF2Q15853 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
USF2Q15853 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
USF2Q15853 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
USF2Q15853 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
USF2Q15853 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
USF2Q15853 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
USF2Q15853 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
USF2Q15853 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
USF2Q15853 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
USF2Q15853 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
USF2Q15853 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
USF2Q15853 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
USF2Q15853 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
USF2Q15853 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
USF2Q15853 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
USF2Q15853 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
USF2Q15853 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
USF2Q15853 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
USF2Q15853 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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