Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AL512413.1-201ENST00000606489 382 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
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VAMP3Q15836 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
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VAMP3Q15836 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
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VAMP3Q15836 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
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VAMP3Q15836 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
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VAMP3Q15836 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
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VAMP3Q15836 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 RNU2-45P-201ENST00000516068 187 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
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VAMP3Q15836 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
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VAMP3Q15836 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
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VAMP3Q15836 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
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