Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 ALMS1-204ENST00000484298 12595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 NAV2-216ENST00000540292 11003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 DNAH17-202ENST00000585328 13708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 RPSAP41-201ENST00000439695 860 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC063923.1-201ENST00000478982 1619 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 NAV2-203ENST00000396085 11000 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AL031963.1-201ENST00000447644 695 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
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