Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SS18Q15532 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SS18Q15532 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SS18Q15532 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SS18Q15532 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SS18Q15532 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SS18Q15532 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SS18Q15532 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SS18Q15532 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SS18Q15532 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SS18Q15532 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SS18Q15532 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SS18Q15532 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SS18Q15532 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SS18Q15532 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SS18Q15532 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SS18Q15532 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SS18Q15532 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SS18Q15532 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SS18Q15532 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SS18Q15532 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SS18Q15532 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SS18Q15532 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SS18Q15532 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SS18Q15532 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SS18Q15532 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
SS18Q15532 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SS18Q15532 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms