Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SMCO1Q147U7 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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