Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms