Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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