Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHD3Q12873 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHD3Q12873 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHD3Q12873 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHD3Q12873 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHD3Q12873 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHD3Q12873 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHD3Q12873 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
CHD3Q12873 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
CHD3Q12873 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
CHD3Q12873 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
CHD3Q12873 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
CHD3Q12873 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
CHD3Q12873 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
CHD3Q12873 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 OR51B4-201ENST00000380224 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHD3Q12873 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
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