Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC3.78□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC3.78□□□□□ -1.81
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PTPRDP23468 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC3.78□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC3.78□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AC011601.1-201ENST00000549710 577 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.78□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC3.78□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC3.78□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC3.78□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.78□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 ZSCAN4-202ENST00000612521 1979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRDP23468 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
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