Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
LRRTM2O43300 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
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