Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms