Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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SH3BP4Q9P0V3 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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SH3BP4Q9P0V3 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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SH3BP4Q9P0V3 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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SH3BP4Q9P0V3 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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