Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms