Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CTXN3Q4LDR2 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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