Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 MEPE-203ENST00000424957 2022 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms