Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
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PUM3Q15397 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
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PUM3Q15397 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PUM3Q15397 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
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