Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RAB39AQ14964 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RAB39AQ14964 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RAB39AQ14964 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RAB39AQ14964 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RAB39AQ14964 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
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RAB39AQ14964 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
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RAB39AQ14964 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
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RAB39AQ14964 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB39AQ14964 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RAB39AQ14964 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB39AQ14964 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB39AQ14964 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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RAB39AQ14964 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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RAB39AQ14964 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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RAB39AQ14964 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB39AQ14964 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB39AQ14964 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
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RAB39AQ14964 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB39AQ14964 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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RAB39AQ14964 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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RAB39AQ14964 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB39AQ14964 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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RAB39AQ14964 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB39AQ14964 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB39AQ14964 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
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RAB39AQ14964 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
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RAB39AQ14964 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
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RAB39AQ14964 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB39AQ14964 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB39AQ14964 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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RAB39AQ14964 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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RAB39AQ14964 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB39AQ14964 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB39AQ14964 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB39AQ14964 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB39AQ14964 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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