Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms