Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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LMAN2Q12907 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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LMAN2Q12907 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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LMAN2Q12907 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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LMAN2Q12907 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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LMAN2Q12907 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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LMAN2Q12907 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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LMAN2Q12907 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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LMAN2Q12907 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
LMAN2Q12907 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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