Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms