Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 HCFC2P1-201ENST00000392864 1592 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AC104126.1-201ENST00000504004 711 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
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