Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
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ARL2-SNX15V9GYD0 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
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ARL2-SNX15V9GYD0 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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ARL2-SNX15V9GYD0 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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ARL2-SNX15V9GYD0 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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ARL2-SNX15V9GYD0 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
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ARL2-SNX15V9GYD0 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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