Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
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