Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 ZNF711-202ENST00000360700 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 PPP2R3A-201ENST00000264977 6795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
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