Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
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SYCP1Q15431 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
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SYCP1Q15431 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
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SYCP1Q15431 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
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SYCP1Q15431 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
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SYCP1Q15431 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
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SYCP1Q15431 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
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SYCP1Q15431 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
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