Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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