Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 DUTP4-201ENST00000424782 475 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 KRTAP3-4P-201ENST00000430780 280 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC021088.1-201ENST00000506519 805 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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CLN3Q13286 AL035410.2-201ENST00000604963 864 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC239809.3-203ENST00000611286 1050 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
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CLN3Q13286 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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CLN3Q13286 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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CLN3Q13286 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC091849.1-201ENST00000509920 121 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC146944.3-201ENST00000509969 371 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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