Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SEMA3BQ13214 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.3 ms