Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms