Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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HOXD13P35453 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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HOXD13P35453 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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HOXD13P35453 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
HOXD13P35453 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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