Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 HSPE1P27-201ENST00000430808 296 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 SETP4-201ENST00000455717 868 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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PTPRMP28827 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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PTPRMP28827 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRMP28827 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
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