Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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HOXD10P28358 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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HOXD10P28358 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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HOXD10P28358 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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HOXD10P28358 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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HOXD10P28358 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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HOXD10P28358 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
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