Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 MTCO1P46-201ENST00000451639 1491 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRDP23468 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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