Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
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USP18Q9UMW8 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
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USP18Q9UMW8 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
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USP18Q9UMW8 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
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USP18Q9UMW8 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
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