Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
ARHGEF3Q9NR81 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111 ms