Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 PPP2R5C-205ENST00000445439 1526 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SLC27A3Q5K4L6 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.3 ms