Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
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