Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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