Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.9 ms