Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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PRPF4BQ13523 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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PRPF4BQ13523 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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PRPF4BQ13523 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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PRPF4BQ13523 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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PRPF4BQ13523 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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PRPF4BQ13523 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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PRPF4BQ13523 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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