Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
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