Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
IFT88Q13099 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms